Thermo Scientific appliedbiosystems SeqStudio Flex Series User Manual page 8

Contents
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CHAPTER 10 Use the instrument with the Security, Auditing, and
E-signature (SAE) v2.1 module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 237
Overview of the Security, Auditing, and E-signature (SAE) v2.1 module components . . . 238
Configuring the SAE module and setting permissions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 239
Functions that are not available when the SAE module is enabled . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 240
Enable SAE mode on the instrument and specify the SAE server (administrator only) . . 240
Disable SAE mode on the instrument (administrator only) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 243
Sign in to the instrument with SAE enabled . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 244
Audit reason requirements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 245
E-signature requirements for starting a spectral, install, or regular run . . . . . . . . . . . . . . . 245
Signing an object before a regular run is started . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 246
Signing an object when a regular run is started . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 247
Signing during an automated barcode run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 249
Displaying signatures . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 249
Use the instrument when the SAE server is offline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250
SAE error messages and actions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 251
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CHAPTER 11 Manage library resources on the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . 252
Overview of libraries . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 253
General library procedures . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 255
Plate files library . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 258
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Basic voice commands . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 234
Interactive voice command-start run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 234
Microphone icon indicators for voice commands . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 235
Create a new entry from a factory-provided or locked entry . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 255
Lock or unlock a library entry . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 255
Copy a library entry . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 255
Edit a library entry . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 256
Import a library entry . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 256
Export a library entry . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 256
Filter library lists . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 257
Delete a library entry . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 258
Plate file definition . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 258
Create a plate file . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 259
Define custom fields . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 262
Export or delete a plate file . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 264
Import a plate setup from a CSV or PSM file . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 264
Plate file Properties tab . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 265
Plate file Plate tab . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 267
Plate file Edit Injection Properties screen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 268
Plate file Edit Well Properties screen (sample name entry) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 271
SeqStudio ™ Flex Series Genetic Analyzer with Instrument Software v1.0 User Guide