Thermo Scientific appliedbiosystems SeqStudio Flex Series User Manual page 12

Contents
Manage settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 452
Manage instrument settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 461
Configure, check status, and cancel background exports and backups . . . . . . . . . . . . . . 465
Set the default save location for results . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 468
Manage storage space . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 468
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APPENDIX A
Troubleshooting workflow . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 472
Troubleshooting resources . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 473
Use Smart Help to request assistance from Technical Support or Instrument Service . . 473
Start a remote support session . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 475
Inspect the data-Troubleshooting procedures . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 476
Inspect the instrument -Troubleshooting procedures . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 480
Additional troubleshooting procedures . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 482
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Display instrument hardware and software information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 452
Configure consumables usage and warnings (administrator only) . . . . . . . . . . . . . . . 453
Set up email notifications from the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 454
Enable SAE mode on the instrument and specify the SAE server
(administrator only) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 455
Enable and set up Demo mode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 457
Enable/disable the internal barcode reader (administrator only) . . . . . . . . . . . . . . . . . 459
Set the power save duration (administrator only) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 459
Enable or disable Thermo Fisher
(administrator only) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 460
Change the instrument name (administrator only) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 461
Manage date and time settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 462
Update the software (administrator only) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 462
Manage the network configuration (administrator only) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 464
Select a language . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 465
Automatic file cleanup (autopurge) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 468
Export results from the instrument-Results and data files, logs, and reports . . . . . 469
Delete a run history . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 469
Back up user data (instrument settings, library items, and results)
(administrator only) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 470
Troubleshooting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 471
View the raw data and the EPT plot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 476
Check size standard quality (fragment analysis) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 476
Check size standard quality (fragment analysis) in the Remote
Monitoring software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 478
View the instrument sensor details and EPT plot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 480
Check the pump for bubbles or debris . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 480
Export troubleshooting logs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 482
Check the position of the cathode buffer container (CBC) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 483
Use the Manual commands function to move instrument components . . . . . . . . . . 483
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