Thermo Scientific ISQ 7000 Hardware Manual page 4

Contents
Chapter 2
iv ISQ 7000 Hardware Manual
Cleaning the Ion Source Cartridge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
Removing the Ion Source Cartridge. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48
Removing the Advanced Ion Source Cartridge on a ISQ 7000 System . . . . . 64
Cleaning the Ion Source Components . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67
Replacing the Ion Source Components . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
Reassembling the Advanced EI Ion Source Cartridge. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 82
Maintaining the Calibration Gas Module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88
Refilling the Calibrant Reservoir . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
Replacing a Dual Filament . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91
Replacing the Electron Multiplier . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 99
Cleaning Durable Components . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Cleaning Delicate Components. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112
Cleaning the Filters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
Troubleshooting. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .115
Using Diagnostics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
Running a Diagnostic Tune . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119
Investigating Communication Issues . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122
Software is not communicating with the ISQ 7000 system.. . . . . . . . . . . . . 122
Cannot download methods to the ISQ 7000 system.. . . . . . . . . . . . . . . . . . 122
GC does not start or is not ready. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122
Sample data are not acquired. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124
GC is not communicating with the PC. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124
Autosampler is not communicating with the PC. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124
Investigating Contamination Issues . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 125
Chemical noise is at m/z 207, 429, 355, 281. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 126
Chemical noise is at m/z 149, 167, 279. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 126
Chemical noise is at m/z 43, 57, 71, 85, 99, etc. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 126
Spectra is showing solvent contamination.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 126
Investigating Filament and Lens Control Issues . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128
Filament has burned out.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128
Filament does not last long. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128
Diagnostics indicate there is a problem with lens voltages.. . . . . . . . . . . . . . 128
Investigating Temperature Issues . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130
Lens/source heater will not heat. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131
Lens/source heater overheats.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131
Transfer line will not heat.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131
Transfer line overheats. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132
Investigating Vacuum Issues . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133
An air leak has been detected. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 134
Foreline pump will not power-on. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 134
Foreline pump powers on, but the system will not pump down. . . . . . . . . . 134
Turbomolecular pump will not power-on.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 134
Turbomolecular pump shuts off while in use. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135
Thermo Scientific