Thermo Scientific TSQ 9000 Hardware Manual page 4

Contents
Chapter 2
iv TSQ 9000 Hardware Manual
Removing the Ion Source Cartridge for Cleaning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
Removing the Ion Source Cartridge. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 44
Disassembling the Ion Source Cartridge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55
Reassembling the Ion Source Cartridge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56
Reinserting the Ion Source Cartridge. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
Maintaining the Calibration Gas Module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
Refilling the Calibrant Reservoir . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
Replacing a Dual Filament . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72
Replacing the Electron Multiplier . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80
Cleaning Durable Components . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88
Cleaning Delicate Components. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92
Cleaning the Filters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94
Troubleshooting. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97
Using Diagnostics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98
Running a Diagnostic Tune . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 102
Investigating Communication Issues . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104
Software is not communicating with the TSQ 9000 system. . . . . . . . . . . . . 104
Cannot download methods to the TSQ 9000 system. . . . . . . . . . . . . . . . . . 104
GC does not start or is not ready. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104
Sample data are not acquired. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
GC is not communicating with the PC. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
Autosampler is not communicating with the PC. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 106
Investigating Contamination Issues . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 107
Chemical noise is at m/z 429, 355, 281. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Chemical noise is at m/z 207, 429, 355, 281. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Chemical noise is at m/z 149, 167, 279. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Chemical noise is at m/z 43, 57, 71, 85, 99, etc. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Spectra is showing solvent contamination.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 108
Investigating Filament and Lens Control Issues . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110
Filament has burned out.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110
Filament does not last long. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110
Diagnostics indicate there is a problem with lens voltages.. . . . . . . . . . . . . . 110
Investigating Temperature Issues . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111
Lens/source heater does not heat.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112
Lens/source heater overheats.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112
Transfer line does not heat. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112
Transfer line overheats. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 112
Investigating Vacuum Issues . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 113
An air leak is detected. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
Foreline pump does not power on. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
Foreline pump powers on, but the system does not pump down. . . . . . . . . 114
Turbomolecular pump does not power on. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
Turbomolecular pump shuts off while in use. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115
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