Troubleshooting Resources - Thermo Scientific Applied Biosystems SeqStudio Genetic Analyzer User Manual

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Troubleshooting resources

SeqStudio Genetic Analyzer Instrument and Software User Guide
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Troubleshooting resources . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 169
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Troubleshooting workflow . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170
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Export log files for plates, install runs, injections, and instrument . . . . . . . . . . 170
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View the raw data and the EPT plot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171
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Data quality alerts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171
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Sizecalling and basecalling quality alerts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171
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Check size standard quality . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172
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Instrument troubleshooting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173
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Cartridge troubleshooting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 174
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Sample and data troubleshooting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175
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EPT data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180
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Software troubleshooting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 181
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Service tools . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 183
Document
Troubleshooting Sanger sequencing data User Bulletin
DNA Sequencing by Capillary Electrophoresis Chemistry
Guide Second Edition
DNA Fragment Analysis by Capillary Electrophoresis User
Guide
Troubleshooting
Pub. No.
MAN0014435
4305080
4474504
169