Thermo Scientific Applied Biosystems QuantStudio 6 Pro User Manual page 7

Options to edit the well details of a plate file . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
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CHAPTER 5 Options for a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
Screens available during a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 70
Edit a plate file during a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
Pause an instrument run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72
Stop an instrument run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 72
View the method during a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
View real-time data and plots during a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
View the time remaining during a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
Lock the touchscreen during a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
Unlock the touchscreen during a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
Instrument Schedule . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
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CHAPTER 6 View and manage files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
Manage plate files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
Manage data files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
QuantStudio ™ 6 Pro Real-Time PCR System and QuantStudio
Set up or remove VeriFlex
Set up or remove the Auto Delta feature . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
Configure ramp rates . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
Add or remove a pause . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
Options to view a plate layout . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
Assign or edit a well for a plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 65
Assign or edit a well for a TaqMan
Add or edit the reagent details for a plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66
Apply the reagents to a plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67
Delete the reagent details . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 67
Add or edit the reagent details for a TaqMan
Apply the reagents to a TaqMan
Edit a passive reference dye . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
Import an Assay Information File (AIF) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
Adjust the display of real-time plots during a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
Overview of the instrument schedule . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
Schedule a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
Cancel a scheduled run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
Copy plate files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 77
Delete plate files . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
View QC Check status after a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 78
View an amplification plot after a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80
Transfer a data file immediately after a run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81
Transfer data files at a later time . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81
View the list of data files on the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 82
Delete data files from the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 82
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Zones . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
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Array Card . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66
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Array Card . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
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Array Card . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
™ 7 Pro Real-Time PCR System User Guide
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