Thermo Scientific Applied Biosystems QuantStudio User Manual page 5

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CHAPTER 6 Troubleshooting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
Troubleshooting chip images using the Chip View . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
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APPENDIX A Install the QuantStudio
Time required for installation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
Materials required . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
Before you begin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61
Plan the laboratory layout . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
Choose the instrument locations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
Install the QuantStudio
Install the ProFlex
Install the GeneAmp
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APPENDIX B Specifications and Layout . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
Component dimensions and weights . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
QuantStudio
Instrument clearances . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80
Electrical specifications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81
Environmental requirements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 82
Network requirements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
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APPENDIX C Maintenance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
Cleaning the chip tray and sample block . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
Configure the instrument settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86
Check the instrument firmware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87
Returning your instrument for service . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89
QuantStudio ™ 3D Digital PCR System User Guide
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3D Digital PCR Instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
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2 × Flat PCR System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
Unpack and place the ProFlex
Prepare the workspace and instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
Install the Tilt Base . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69
Unpack and install the sample block module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
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Set up the ProFlex PCR System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 71
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PCR System 9700 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73
Unpack and place the GeneAmp
Unpack and install the Dual Flat Block Module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 74
Install the Tilt Base and Chip Adapter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
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Set up the GeneAmp PCR System 9700 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 75
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3D Digital PCR Instrument layout and connections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80
Materials required . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84
Clean the chip tray or sample block . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85
(Optional) Set the instrument name . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 86
Set the date and time . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87
Update the instrument firmware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88
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3D Digital PCR System . . . . 61
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PCR System Base Module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68
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PCR System 9700 Base Module . . . . . . . . . . . . . . 73
Contents
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