AB Sciex QTRAP 4500 LC/MS/MS system System User's Manual page 7

Navigate Between Samples in a Data File . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77
Show Experimental Conditions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78
Show Data in Tables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Show ADC Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80
Show Basic Quantitative Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81
Chromatograms . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81
Show TICs from a Spectrum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82
Show a Spectrum from a TIC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82
Generate XICs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82
Generate BPCs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .84
Generate XWCs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86
Show DAD Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86
Generate TWCs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87
Adjust the Threshold . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87
Data Processing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .89
Graphs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .89
Zoom In on the Y-axis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .91
Zoom In on the X-axis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .91
Chapter 11 Operating Instructions - Analyze and
Process Quantitative Data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95
Quantitative Analysis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .95
Quantitation Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .95
About Results Tables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96
Quantitation Methods and Results Tables . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96
Create a Method using the Quantitation Method Editor . . . . . . . . . . . . . . . . .96
Create a Results Table using the Quantitation Wizard . . . . . . . . . . . . . . . . . .97
Create a Standard Query . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .98
Results Table Right-Click Menu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .101
Peak Review and Manual Integration of Peaks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .102
Review Peaks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .102
Manually Integrate Peaks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105
Peak Review Right-Click Menu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .107
Calibration Curves . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .107
View Calibration Curves . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .108
Overlay Calibration Curves . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .109
Calibration Curve Right-Click Menu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .109
Sample Statistics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .110
View the Statistics for Standards and QCs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .110
Compare Results Between Batches . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .111
Chapter 12 Reporter Software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115
Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .115
Reporter User Interface . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .116
Generate Reports . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .117
Chapter 13 Service and Maintenance Information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119
Clean the Surfaces . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .120
Clean the Front-End . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .121
Best Practices . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .122
System User Guide
RUO-IDV-05-0264-A
Contents
4500 Series of Instruments
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