Thermo Scientific TSQ Series Hardware Manual page 12

Contents
Chapter 3
Chapter 4
Chapter 5
xii TSQ Series Hardware Manual
Mass Spectrometer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18
Controls and Indicators . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18
API Source . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .21
Ion Source Interface . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22
Ion Optics . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .23
Mass Analyzer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27
Ion Detection System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .33
Vacuum System and Inlet Gases Hardware. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .35
Electronic Assemblies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
Data System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .41
Computer Hardware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .41
Data System / Mass Spectrometer / LC Interface . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42
Data System / Local Area Network Interface . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42
Printer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42
System Shutdown, Startup, and Reset . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45
Shutting Down the System in an Emergency . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45
Placing the System in Standby Condition. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47
Shutting Down the System Completely . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .48
Starting Up the System after a Complete Shutdown. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49
Starting Up the LC. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49
Starting Up the Data System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49
Starting Up the Mass Spectrometer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .50
Starting Up the Autosampler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51
Setting Up Conditions for Operation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51
Resetting the Mass Spectrometer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .52
Resetting the Data System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .52
Resetting the Data System by Using the Windows Shutdown and Restart
Procedure . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .52
Resetting the Data System by Turning the Personal Computer Off Then On 53
Turning Off Selected Mass Spectrometer Components . . . . . . . . . . . . . . . . . . .53
Daily Operation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57
Things to Do Before Operating the TSQ System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57
Checking the Argon and Nitrogen Supplies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .58
Checking the ESI Fused-Silica Sample Tube for Elongation. . . . . . . . . . . . . .58
Checking the System Vacuum Levels . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .58
Things to Do After Operating the TSQ System . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59
Flushing the Sample Transfer Line, Sample Tube, and API Probe . . . . . . . . .60
Placing the System in Standby Condition. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .61
Cleaning the Ion Sweep Cone and Ion Transfer Tube . . . . . . . . . . . . . . . . . .61
Emptying the Solvent Waste Bottle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
Removing and Reinstalling the Ion Source Housing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
Removing the Ion MAX or Ion MAX-S Ion Source Housing . . . . . . . . . . . . . . .63
Installing the Ion MAX or Ion MAX-S Ion Source Housing . . . . . . . . . . . . . . .65
Ion MAX and Ion MAX-S Housing Maintenance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66
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