Applied Biosystems QuantStudio 6 Flex User Manual page 4

Contents
Enable or change the calibration reminders . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
Guidelines for preparing calibration plates and array cards . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 36
Preparing array cards for instrument calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
ROI calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
Background calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45
Uniformity calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
Dye calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53
Normalization calibration
Verify the instrument performance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
4
Calibration workflow . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
View the calibration status of an instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 29
Requirements to email calibration reminders . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
Define the mail server settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 32
Modify the notification settings for a monitored instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 34
Required materials . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
Fill the calibration TaqMan
When to perform the calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41
About the calibration data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
Preparing the calibration plate or array card . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
Prepare the ROI calibration plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42
Perform the ROI calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 43
When to perform the calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
About the calibration data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
Preparing the calibration plate or array card . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
Prepare the background calibration plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46
Perform the background calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
When to perform the calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49
Preparing the calibration plate or array card . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
Prepare the ROI calibration plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50
Perform the uniformity calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51
When to perform the calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53
About the dye calibration data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53
Preparing the calibration plate or array card . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
Prepare the dye calibration plates . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54
Perform the dye calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56
(TaqMan
When to perform the calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
About the calibration data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
Preparing the calibration array card . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
Perform the normalization calibration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59
When to perform the test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
About the RNase P kits . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
Analytical performance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 63
Installation specification . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
Prepare the RNase P plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
QuantStudio 6 and 7 Flex Real-Time PCR Systems v1.6 Maintenance and Administration Guide
™
®
Array Cards . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37
®
Array Card only) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59