Table Of Contents - Thermo Scientific Ion GeneStudio S5 User Manual

About this guide . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
Purpose of the guide . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
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CHAPTER 1 Product information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
Contents . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
Required materials and equipment not supplied . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 8
Instrument installation by trained personnel only . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
Nucleic acid contamination . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
Instrument vibration and clearances . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
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CHAPTER 2 System components . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Ion GeneStudio S5 System component configuration and layout . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Internet connectivity . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
Ion GeneStudio S5 System component positions . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
Ion GeneStudio S5 Sequencer input and output connections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13
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CHAPTER 3 Instrument operation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
Power the Ion GeneStudio S5 Sequencer on or off . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
Update the Ion GeneStudio S5 System software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
Ion GeneStudio S5 instrument run times . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
Maintain the sequencer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
Ion GeneStudio S5 Instrument User Guide
Power on . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
Power off . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
Required materials . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
Clean or decontaminate the sequencer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
Perform the sequencer cleaning manually . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
Perform an instrument reset run with an initialized, unused Sequencing
Reagents cartridge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
Contents
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