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Summary of Contents for VWR Peqlab PerfectBlue Mini S
- Page 1 Instruction Manual – Bedienungsanleitung PerfectBlue ™ Horizontal Mini Gel Systems / Horizontale Minigelsysteme Mini S, M, L & Mini L 'Revolution'...
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Page 3: Table Of Contents
Instruction Manual PerfectBlue Horizontal Mini Gel Systems CONTENTS WARRANTY PACKAGING LIST SAFETY PRECAUTIONS SYSTEM OVERVIEW Technical properties GENERAL INSTRUCTIONS Setting up the system and pouring the agarose gel Loading of samples and electrophoresis Visualisation Cleaning REQUIRED REAGENTS & RECIPES Electrophoresis buffers Agarose: Gel volumes and percentage Ethidium bromide Loading buffer/Sample buffer... -
Page 4: Warranty
No liability is accepted for loss or damage arising from incorrect use. VWR's liability is limited to the repair or replacement of the unit or refund of the purchase price, at VWR's discretion. VWR is not liable for any consequential damages. After the warranty period has expired, VWR can offer repairs. -
Page 5: System Overview
In total VWR offers 6 different Mini Gel Systems. In addition to the Mini S, M, L and L 'Revolution' mod- els that are described here, two wide-format Mini Gel Systems are available (Mini ExM and Mini ExW). -
Page 6: General Instructions
Instruction Manual PerfectBlue Horizontal Mini Gel Systems GENERAL INSTRUCTIONS Setting up the system and pouring the agarose gel 1. Remove the lid from the gel box by holding the front of the buffer chamber with one hand and pull- ing the lid off by holding the center of the back of the lid. 2. -
Page 7: Loading Of Samples And Electrophoresis
Instruction Manual PerfectBlue Horizontal Mini Gel Systems Loading of samples and electrophoresis 1. Once the gel is completely solidified, lift the tray out of the chamber, turn it 90 °, and replace it in the chamber with the first comb closest to the cathode side (black electrode) of the chamber. The running position exposes the open ends of the agarose to the buffer. -
Page 8: Visualisation
Instruction Manual PerfectBlue Horizontal Mini Gel Systems Visualization When the tracking dye has migrated as far through the gel as desired, or to the end of the gel, turn off the power supply and slide off the lid to disconnect from the power source. Carefully remove the tray containing the gel (wear gloves). -
Page 9: Required Reagents & Recipes
TBE should be selected for performing extended electrophoresis separations and if the electro- phoresis chamber does not possess a system for buffer recirculation. VWR's PerfectBlue 'Revolution' Systems are equipped with an internal buffer recirculation system that prevents the formation of pH and ion gradients during extended runs. -
Page 10: Agarose: Gel Volumes And Percentage
Horizontal Mini Gel Systems Agarose: Gel volumes and percentage VWR offers an extensive range of high quality agaroses, for many specific applications (see 'TECHNICAL SUPPORT AND ORDERING INFORMATION'). The required volume of the gel is calculated using the following formula. -
Page 11: Loading Buffer/Sample Buffer
By running a known marker of a specific concentration in parallel, the DNA amount of the unknown samples can be estimated. VWR offers an extensive range of DNA and RNA markers. For detailed information please contact us or visit www.de.vwr.com. - Page 12 Instruction Manual PerfectBlue Horizontal Mini Gel Systems Problem: Samples do not band sharply. Gels should be allowed to solidify completely before running. Standard agarose should solidify in about 30 minutes. If low melting point agarose is used, it may be necessary to completely solidify gels at a cooler temperature in the refrigerator or cold room.
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Page 13: Technical Support And Ordering Information
Instruction Manual PerfectBlue Horizontal Mini Gel Systems TECHNICAL SUPPORT AND ORDERING INFORMATION For technical questions and more detailed information on VWR’s products please visit www.de.vwr.com to find the respective contact person. PerfectBlue Mini S ™ Item Description Cat. No. Gel system Mini S... -
Page 14: Perfectblue ™ Mini L & Mini L 'Revolution
Instruction Manual PerfectBlue Horizontal Mini Gel Systems PerfectBlue Mini L & Mini L 'Revolution' ™ The same accessories are used for both models, Mini L and Mini L 'Revolution'. Item Description Cat. No. Gel system Mini L complete system for gels 12 x 14 cm (W x L) PEQL40-1214 Gel system Mini L 'Revolution' complete system for gels 12 x 14 cm (W x L) PEQL40-1214R... -
Page 15: Power Supplies
Instruction Manual PerfectBlue Horizontal Mini Gel Systems Power Supplies Do not hesitate to contact us for advice on which Power Supply is most suitable for your application. Agaroses Item Purpose Amount Cat. No. peqGOLD Universal-Agarose Suitable for standard applications. Sepa- 100 g PEQL35-1010 ration range between 0.05 and 50 kb. -
Page 16: Literature
Instruction Manual PerfectBlue Horizontal Mini Gel Systems LITERATURE J, F E. F. T. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold AMBROOK RITSCH ANIATIS Spring Harbor Laboratory Press, NY. M. A et al. (Ed.) Short Protocols in Molecular Biology, - A Compendium of Methods from REDERIK USUBEL Current Protocols in Molecular Biology. - Page 17 Bedienungsanleitung PerfectBlue Horizontale Minigelsysteme INHALT GARANTIE LIEFERUMFANG SICHERHEITSHINWEISE SYSTEMÜBERBLICK Technische Merkmale ALLGEMEINE BEDIENUNGSHINWEISE Vorbereitung des Systems und Gießen des Agarosegels Beladen des Gels und Elektrophorese Auswertung/Dokumentation Reinigung BENÖTIGTE MATERIALIEN & REZEPTE Elektrophoresepuffer Agarose: Gelvolumen und -Konzentration Ethidiumbromid Lade- oder Probenpuffer Längenstandards TROUBLESHOOTING TECHNISCHER SERVICE &...
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Page 18: Garantie
Vereinbarung besteht. Ansprüche auf Ersatz oder Reparatur, die aus einer fehlerhaften Verwendung entstanden sind, werden nicht erfüllt. Die VWR GmbH verpflichtet sich zur Reparatur oder dem Ersatz des Gerätes bzw. der Rückerstattung des Kaufpreises nach ihren Bedingungen. VWR haftet nicht für Folgeschäden, die aus der Verwendung des Systems entstanden sind. -
Page 19: Systemüberblick
JustCast ist darüber hinaus für das komfortable Abdichten sämtlicher Minigelträger geeignet. VWR bietet eine Vielzahl von Standard- und Mikrotiterkämmen (nicht erhältlich für Mini S) in zwei ver- schiedenen Dicken (1 und 1.5 mm) an. Mikrotiterkämme erlauben das zeitsparende Beladen der Gele mit Mehrkanalpipetten. -
Page 20: Allgemeine Bedienungshinweise
Bedienungsanleitung PerfectBlue Horizontale Minigelsysteme ALLGEMEINE BEDIENUNGSHINWEISE Vorbereitung des Systems und Gießen des Agarosegels 1. Entfernen Sie den Sicherheitsdeckel von der Gelkammer durch Festhalten der Pufferkammer mit der einen Hand und Ziehen an der Rückseite des Deckels mit der anderen Hand. 2. -
Page 21: Beladen Des Gels Und Elektrophorese
Bedienungsanleitung PerfectBlue Horizontale Minigelsysteme Beladen des Gels und Elektrophorese 1. Sobald das Gel vollständig fest ist, kann der Gelträger für den Gellauf passend eingesetzt werden, d.h. wie oben beschrieben herausgenommen und um 90 ° versetzt wieder in die Pufferkammer ein- gesetzt werden, so dass die offenen Enden des Gelträgers zu den Pufferreservoiren gerichtet sind. -
Page 22: Auswertung/Dokumentation
Bedienungsanleitung PerfectBlue Horizontale Minigelsysteme Auswertung/Dokumentation Zum Abbrechen der Elektrophorese sollte der Power Supply abgeschaltet und der Deckel der Gelkam- mer heruntergeschoben werden, um die Pufferkammer von der Spannungsquelle zu trennen. Erst dann darf der Gelträger aus der Pufferkammer gehoben werden. Sind Ethidiumbromid oder sonstige interkalierenden Farbstoffe im Gel oder Puffer enthalten, ist direkter Hautkontakt unbedingt zu vermei- den (Handschuhe!). -
Page 23: Benötigte Materialien & Rezepte
Pufferkapazität von TAE ist für zeitlich ausgedehnte Elektrophoresen jedoch TBE zu empfehlen, sofern die Pufferkammer nicht über ein Pufferrezirkulationssystem verfügt (wie z. B. die PerfectBlue™ 'Revolution'-Systeme von VWR), welches die Ausbildung eines pH-Gradienten (alkalische Anodenseite, saure Kathodenseite) verhindert. Da Agarose in TBE-Puffer außerdem feinere Poren und eine festere Matrix bildet, wird die vom elektrischen Feld unabhängige Diffusion der DNA verringert... -
Page 24: Agarose: Gelvolumen Und -Konzentration
Bedienungsanleitung PerfectBlue Horizontale Minigelsysteme Agarose: Gelvolumen und -Konzentration VWR bietet eine Reihe hochwertiger Agarosen an, die für verschiedenste Anwendungen geeignet sind (siehe 'TECHNISCHER SERVICE & BESTELLINFORMATIONEN'). Das benötigte Gelvolumen errechnet sich nach folgender Formel: Gelbreite (cm) x Gellänge (cm) x Geldicke (cm) = ml Agaroselösung Abhängig von der Geldicke ergeben sich somit folgende Gelvolumina:... -
Page 25: Lade- Oder Probenpuffer
Markers aufgetragen, kann auch die DNA-Menge einer Bande bestimmt wer- den. Größenmarker bestehen z. B. aus entsprechend verdauter Plasmid-DNA mit Fragmenten bekannter Größe. VWR bietet eine Vielzahl an DNA- und RNA-Markern an. Informationen hierzu finden Sie in unserem aktuellen Produktkatalog oder unter www.de.vwr.com. - Page 26 Bedienungsanleitung PerfectBlue Horizontale Minigelsysteme Problem: Proben zeigen kein scharf begrenztes Bandenmuster. Evtl. hat sich die Gellösung vor Beginn der Elektrophorese nicht vollständig verfestigt. Handelsübliche Standardagarose ist nach ca. 30 Minuten bei RT vollständig erstarrt. Wird Low-Melting Agarose ver- wendet, sollte das Gel zum Festwerden bei niedrigeren Temperaturen gelagert werden, z.B. im Kühl- schrank.
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Page 27: Technischer Service & Bestellinformationen
TECHNISCHER SERVICE & BESTELLINFORMATIONEN Bei technischen Fragen kontaktieren Sie uns bitte unter +49 (0)9131 610 7020 oder per e-mail an in- fo.peqlab@vwr.com. Ausführliche Informationen zu unseren Produkten finden Sie in unserem aktuellen Produktkatalog, den wir Ihnen auf Wunsch gerne zusenden oder unter www.de.vwr.com. -
Page 28: Perfectblue ™ Mini L & Mini L 'Revolution
Bedienungsanleitung PerfectBlue Horizontale Minigelsysteme PerfectBlue Mini L & Mini L 'Revolution' ™ Für die Gelkammern Mini L und Mini L 'Revolution' wird das identische Zubehör verwendet. Artikel Beschreibung Bestell-Nr. Gelsystem Mini L vollständiges System für Gele 12 x 14 cm (B x L) PEQL40-1214 Gelsystem Mini L 'Revolution' vollständiges System für Gele 12 x 14 cm (B x L) -
Page 29: Power Supplies
Bedienungsanleitung PerfectBlue Horizontale Minigelsysteme Power Supplies Bei Bedarf beraten wir Sie gerne, welcher Power Supply für Ihre Anwendung geeignet ist. Agarosen Artikel Anwendung Menge Bestell-Nr. peqGOLD Universalagarose geeignet für Standard-Auftrennungen von 100 g PEQL35-1010 Nukleinsäuren im Bereich von 0.05 – 50 kb 500 g PEQL35-1020 1000 g... -
Page 30: Literatur
Bedienungsanleitung PerfectBlue Horizontale Minigelsysteme LITERATUR J, F E. F. T. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold AMBROOK RITSCH ANIATIS Spring Harbor Laboratory Press, NY. M. A et al. (Ed.) Short Protocols in Molecular Biology, - A Compendium of Methods from REDERIK USUBEL Current Protocols in Molecular Biology.