Table Of Contents - Thermo Scientific Applied Biosystems SeqStudio Genetic Analyzer Getting Started Manual

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CHAPTER 1 Product information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
Product description . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6
Workflow . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 7
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CHAPTER 2 Prepare the samples and the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . 9
Prepare the samples . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
Prepare the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
Prepare and load the plate or tubes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
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CHAPTER 3 Set up a plate using default settings (Plate
Manager) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
Access the Plate Manager . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16
Create or open a plate setup PSM file . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
Enter plate properties . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17
Assign wells: Sample and run information . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18
Save a plate setup in the Plate Manager . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 20
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CHAPTER 4 Set up a plate using default settings (instrument) . . . . 22
Sign in . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22
(Optional) Set up for auto export of sample data files (AB1 and FSA) . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23
Create or import a plate setup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
Enter plate properties . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25
Assign wells: run module, size standard, dye set, and kit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26
SeqStudio Genetic Analyzer Instrument and Software Getting Started Guide
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Sample preparation guidelines . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
Plate layout and loading guidelines . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
Power on the instrument . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
Check the consumables status . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11
Load the CBC, the sample plate, and the cartridge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12
Prepare the plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
Prepare the tubes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 14
Load the plate or the tube assembly . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
Unload the plate or the tube assembly . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15
Export or delete a plate setup (PSM file) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24
Contents
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