Download
Share
Print this page
  1. Manuals
  2. Brands
  3. Olympus Manuals
  4. Microscope
  5. Fluoview FV1000
  6. User manual

Olympus FV1000 User Manual

Mpe microscope
Hide thumbs Also See for FV1000:
1
2
3
4
5
6
7
8
9

Advertisement

Quick Links

Download this manual See also: User Manual
Olympus FV1000 User guide 
Olympus FV1000 MPE Microscope User Guide
A.  System Start Up
1. Sign in to the log book. Indicate the laser lines you will use; visible laser and IR laser. 
2. Turn on mercury lamp power supply 
3. Turn on microscope controller and scanner. 
Microscope controller‐ switch ON 
Scanner – switch ON and turn Key to ON 
4. Turn on laser combiners 
5. Turn on laser power supplies 
g
Multi‐Ar 
: Switch to ON and turn Key to ON. 
h
HeNe 
: Turn Key to ON. 
i
6. Turn on computer 
7. Enter user name/password to log on to Windows XP.  
8. Start the FV10‐ASW program and enter User ID and 
password.  
 
b
.
 
c
 
d
. 
ef
. 
 if it is not on. 
 
g
f
d
b
h
e
August 3, 2011
 
 
c
i

Advertisement

loading

Related Manuals for Olympus FV1000

Summary of Contents for Olympus FV1000

  • Page 1 Olympus FV1000 User guide  August 3, 2011   Olympus FV1000 MPE Microscope User Guide A.  System Start Up 1. Sign in to the log book. Indicate the laser lines you will use; visible laser and IR laser.  2. Turn on mercury lamp power supply    3. Turn on microscope controller and scanner.  Microscope controller‐ switch ON    Scanner – switch ON and turn Key to ON    .    4. Turn on laser combiners  .  5. Turn on laser power supplies  Multi‐Ar  : Switch to ON and turn Key to ON.  HeNe  : Turn Key to ON.  6. Turn on computer   if it is not on.  7. Enter user name/password to log on to Windows XP.   8. Start the FV10‐ASW program and enter User ID and  password.  ...
  • Page 2 Olympus FV1000 User guide  August 3, 2011   B. Outline of Acquisition Setting / Image Acquisition/ Image Viewer Windows ...
  • Page 3 Olympus FV1000 User guide  August 3, 2011       Folder/File    Explorer            Data manager: displays    metadata containing    acquisition parameters.            C. Viewing with Transmitted or Epifluorescence  Light  Before scanning the sample with laser light, look at  the sample and find the region of interest first with    either transmitted or fluorescent light.    Click on transmitted light button  for transmitted  light viewing or on epifluorescence light button   for  fluorescence viewing (Before click on the light button  you will used, click off the pressed button first).      Turn the filter wheel   to #6 (DICT) for transmitted  light viewing, or to #3 (Green NIBA), 4 (Red WIG), or  5 (DAPI) for fluorescent light viewing.  Open the ...
  • Page 4 Olympus FV1000 User guide  August 3, 2011   D. Image Acquisition  Click off the light source button   to turn off    the non‐laser light.     Click on Dye list  button and double click           on the fluorescent dyes you want to use (e.g.    FITC and TRITC) from the list.  Click Apply  button  (if Assign Dye Manually button  is  checked, uncheck before pressing Apply  button).  It will activate the laser lines and set  detection channels up according to the dyes    you selected.     Choose Image size (default‐ 512x512) from  Size panel .      Press   button (if not pressed) to  automatically adjust HV and Offset values  according to the scan speed change.  Click   button to scan the sample.  It will  scan fast at 2 us/pixel and show low‐quality  (pixelated) image in a Live View window.    ...
  • Page 5 Olympus FV1000 User guide  August 3, 2011   You can optimize the image quality with Hi‐Lo LUT (Look‐Up Table).  Click LUT   button to bring the LUT  control window and select Channel and click Hi‐Lo button (Ctrl‐H  shortcut key will do the same without opening LUT window).  Now  the image is displayed using this specific look‐up table where red  pixels represent intensity beyond scale (saturated) and blue pixels  represent 0 pixel value.  To maximize the signal‐to‐noise ratio of the  image, adjust the acquisition setting (laser power level, HV, Offset)  such that the image shows a few red and blue pixels while you are  scanning.   Often excitation/emission profiles of fluorophores you are using may  be close, so there could be possible bleed‐through of a fluorophore  emission to neighboring channel. To minimize this, the detecting  range of each channel can be adjusted by changing Spectral Setting.  Click on  , it will bring Spectral Setting window. Change the range  of spectrum for each channel (CHS1 and CHS2) by sliding, widening,  or narrowing the tabs   or arrowheads.    Use Area panel   to rotate and zoom the imaging area (click on 0 and 1 buttons to return to the original  viewing area).  To rotate the viewing area, click on the red dot and drag clock‐ or counter‐clockwise.  With  zoomed view, you can select the scanning area by moving the blue‐lined box around. To zoom a specific region  in, click   icon and draw a box on the live view area. It will zoom in the area specifically.     Once you are satisfied with the setting, stop scanning.  Set the scan speed  to slow rates (~10‐12.5us/pixel)  (the slower the speed set, the better the signal‐to‐noise ratio, but the more bleaching).  Click XY button  to acquire an image.  When acquisition is done, a 2D view window will appear.    E. Z‐Series Image Acquisition  Use this mode to obtain optical section through the depth (z  dimension) of your sample that can be used for 3D visualization.   Click ...
  • Page 6 Olympus FV1000 User guide  August 3, 2011   Click Stop  button.  Adjust the Scan Speed if needed, click Depth  button (“Z” will be appear on the XY  button to become XYZ), and then click XYZ  button.    When acquisition is done, Append Next/SeriesDone  button will appear over the Stop button. Click    Append Next button to add additional sections at next  step (enter the number of series you want to add) or  click SeriesDone to finish the acquisition.  Save the image.     F. Sequential Scanning Mode  Use sequential scanning to prevent possible  cross‐talk and/or bleed‐through between the  emissions of the fluorophores you used.     Check the Sequential box   and it will bring up  the sequential scan information window.  Choose  between Line or Frame mode  .     Line: by line‐by‐line, it scans one channel with  only a specific laser line and detector on and then  sequentially scans the next channel with only a  another laser line and detector on.  Frame: it scans sequentially frame‐by‐frame; it  finishes scanning one channel first and then scans  the next channel.      If there is no bleed‐through  between the emissions of some  fluorophores you are using, you  can group them together to scan  them simultaneously as a group.  Simply click on the fluorophore name on the list and drag to the other group.  ...
  • Page 7 Olympus FV1000 User guide  August 3, 2011   G. Saving and Exporting Images 1. Click on the image window to be saved.     2. Click on  icon or select File/Save or Save as from  menu.     3. A Save as window will appear. In case the image should  be saved in the Image folder of a Log‐in user, click on   button and it will direct to your image folder.   Select Olympus Image Binary Format *.oib file type,  type file name, and click on Save button. (Log‐in user  and its associate folder will be created as you become  self‐user).    4. To set up your image folder where you can jump directly by  clicking My Image Folder button, select Tools/Option menu.   Click General tab and specify the path of your image folder  with Browse.. button.  [Upon creating a user account, each  user will have its own folder in D drive (Do not create any  folder in C drive.).  Click OK button.     5. Oib file type contains all the metadata including all the  acquisiotn parameters and it can be opened in FV10‐ASW  program. The light version of this program is available for  installing in user’s own computer.   Otherwise, the image  file can be exported as other file format so that it can be opened and processed in other imaging software.     To export images: ...
  • Page 8 Olympus FV1000 User guide  August 3, 2011   3. File/Export command brings a window with  different options.   This command will export images into a  folder that contain individual images of each  channel, z‐steps, or time‐points.     Select File type  for export.  ROI Overlay   section allows saving the file  with ROI information.  Output Format  :  RGB Color: the red, green, and blue channel  will be saved in color as individual *.tif files in  a folder.  c  RGB Color + Gray Scale box checked: the  color channels will be saved in gray scale as  *.tif files in a folder.   Merge Channel: a single merged color image  will be saved as a *.tif file.     Frame Rate determine the play speed of  the movie when the file is exported as AVI.  Check the AVI box to compress the movie file.     4. Check the Save Properties As ASCII Text button if you export the metatdata. Click Save button.     5. Transfer your image data to CD or USB flash memory.       ...
  • Page 9 Olympus FV1000 User guide  August 3, 2011   G. System Shut‐Down Procedure  Wipe off the oil from any oil objectives you have used    during your session.    Logging off and transferring data.   1. Exit the FV10‐ASW program.  2. Make sure that you transfer your image file to  CD or USB flash memory.  All image files more  than a month old will be removed during  monthly clean‐up.   3. Log off Windows XP.  If someone signs up for use  within a next 1 hour or so, leave the system ON.   If not, shut down the system as follows.    Shutting Off the system.  1. Shut down the computer  .   2. Turn the mercury lamp off  .   3. Turn the microscope controller key to OFF and turn  off both scanner and controller I/O switches  .   e  4. Turn off the laser combiners , FV10‐MCPSU and  FV10‐MP‐LCU.   5. Turning off the Multi‐Ar laser  by turning the key ...