Hide thumbs Also See for ASSURANCE GDS PPMX:

Advertisement

Quick Links

ASSURANCE GDS® PPMX 
USER MANUAL
 
 
12822 SE 32nd Street 
 
Phone 425.603.1123 
 
info@biocontrolsys.com
Bellevue, WA, USA 98005 
Fax 425.603.0070 
www.biocontrolsys.com
55240.R003.082016 

Advertisement

Table of Contents
loading
Need help?

Need help?

Do you have a question about the ASSURANCE GDS PPMX and is the answer not in the manual?

Questions and answers

Summary of Contents for Biocontrol ASSURANCE GDS PPMX

  • Page 1 ASSURANCE GDS® PPMX  USER MANUAL     12822 SE 32nd Street    Phone 425.603.1123    info@biocontrolsys.com Bellevue, WA, USA 98005  Fax 425.603.0070  www.biocontrolsys.com 55240.R003.082016 ...
  • Page 2: Table Of Contents

    Table of Contents  Safety ........................4 Voltage Safety Interlock Pipette Heads Tip Waste Container Tray Liquids Replacement Parts Introduction ......................6 Standard Equipment Documentation Protocols Disposables Technical Specifications Setup/Operation ....................9 III. Unpacking Removable Tray Rear Panel Connections Front Panel Connections UPS Battery Power and Line Conditioner Power On and Start Up Log In User Management Touchscreen Overview Alignment Protocol Add Pipette and PickPen Head(s) Set Date & Time Install Chime Sound Box Run a Protocol Step‐by‐step Wizard ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL ...
  • Page 3 Pause or Stop a Running Protocol View Results Run Report Log Out LIMS Compatibility Import Protocol Export Protocol Delete Protocol Change PPMX Serial Number in Software Troubleshooting ....................23 Communication Loss Re‐starting a Protocol after Communication Loss Hood Open Reporting an Error Technical Services Maintenance ....................... 25 Cleaning Pipette Head Calibration Alignment Calibration Preventative Maintenance Warranty Instrument Return Procedure Appendix A ......................27 Parts List Appendix B ......................29 VII. Before You Call Us Appendix C ......................30 VIII. Maintenance Log Appendix D ......................
  • Page 4 Best Practices Appendix G......................35 XII. Pack Up Appendix H ......................39 XIII. Ordering Information ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL ...
  • Page 5: Safety

    Safety  Read this section before installing and operating the Assurance GDS® PPMX.    This instrument is intended to be used in a laboratory environment by trained technical personnel.    For safe and proper use of this instrument, it is required that both operating and service personnel follow the  instructions contained in this guide when installing, operating, cleaning, and maintaining the instrument.    The following safety precautions must be observed during all phases of operation, service, and repair of the  instrument. Failure to comply with these precautions or with specific warnings elsewhere in this user’s guide  violates safety standards of design, manufacture, and intended use of the instrument. BioControl Systems  assumes no liability for the customer’s failure to comply with these requirements.  The PPMX has been certified to safety standards required in Canada, Europe, and the United States. Refer to the  instrument rear panel label and the Declaration of Conformity document for the current standards to which the  instrument has been found compliant.  The following electronic and hazard symbols may appear on the instrument:  The following safety notices may appear in this document:  Voltage  Access to the rear panel is necessary because the instrument must be detached from all voltage sources before  service, repair, or exchange of parts.  Operate the instrument using the approved power supply provided and only at the voltage specified on the rear  panel label of the instrument.  ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL...
  • Page 6: Safety Interlock

    The  instrument  is  capable  of  generating  significant  forces  that  could  cause  potential  injury  to  the  user.  For  an  instrument with the rotating cover installed, the safety interlock in the cover will disable the instrument movement  if the cover on the instrument is open. For an instrument installed in a hood, the external safety interlock sensor  mounted on the instrument will disable the instrument movement if the hood door is open.   Tip Waste Container  The tip waste container should be emptied in accordance with national and local safety regulations.    Tray  The moving tray is capable of causing injury by pinching. For an instrument with the rotating cover installed, the  safety interlock in the cover will disable the instrument movement if the cover on the instrument is open.   Liquids  Observe safe laboratory practices when handling liquids. If working with biological samples or chemical substances,  ensure  that there  is  proper  ventilation,  and  wear  personal  protective  equipment  (PPE),  such  as  safety  glasses,  gloves, and protective clothing at all times.    Refer to the Safety Data Sheets for solvents before use.    Replacement Parts  Be sure to use only replacement parts specified in this user manual. Do not repair or change parts which are not  listed in this user manual. If it is necessary to change parts not listed, please contact BioControl Systems  technical services.  ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL...
  • Page 7: Introduction

    Introduction  The Assurance GDS PickPen® PIPETMAX® (PPMX) is an automated magnetic particles and liquid handler. It is  capable of dispensing Assurance GDS reagents which include, Concentration Reagent, Wash Solution,  Resuspension Buffer and select media (BHI/DFB).  Reagent dispense protocols have been created for all Assurance  GDS assays.  In addition, the PPMX has also been programmed to automate Assurance GDS PickPen  Immunomagnetic Separation (IMS) procedures.  This user manual is intended to assist PPMX users with system  start‐up, basic operation, maintenance and service.      Standard Equipment  After the PPMX and accessories are unpacked, the following items should be present:    PPMX Instrument with rotating cover   • Alignment Head   • Removable Tray 96 well   • Pipette Tip Reload Rack  • PickPen Tip Reload Rack   • Tip Disposal Bin   • Power Supply (110V/220V)  • Power/USB Cabling kit  • Power Cords (US and EU)  • USB Cable  • • Back Plug, Black  • Allen Wrench, 5 mm  • MAX8x200 Pipette Head  • Assurance GDS PickPen Magnetic Head  • Assurance GDS Reagent Holder  •...
  • Page 8: Documentation

    System also comes with either:    Control Tablet with TRILUTION micro software pre‐loaded + Charger and Tablet holder  • or  Microsoft Surface laptop with TRILUTION micro software pre‐loaded + Charger and Keyboard cover/Pen  •   These items come with US plugs only.  For part numbers, refer to Appendix A, Parts List.  For ordering  information, refer to Appendix H, Ordering Information.    Documentation  The following documents are included with the PPMX:    • PPMX User Manual  Gilson Quick Setup Guide  • • Gilson Installation and Operational Qualification (IQ/OQ) Procedures  Gilson Declaration of Conformity  • Gilson Validation Certificate for TRILUTION micro  • Gilson Quality Control Report Pipette Head   •   Protocols  Alignment Protocol  • • Assurance GDS Reagent Dispense protocols (R‐)  Assurance GDS PickPen IMS protocols (IMS‐)  • • Assurance GDS Combined Reagent and IMS protocols (C‐)    Disposables  The items below are sold separately but are required for use:  200 µL Sterile Blister Filter Tip Packs   •...
  • Page 9: Technical Specifications

    Technical Specifications  Please be aware of the following before operating the PPMX.    Changes or modifications to this device not expressly approved by BioControl Systems  could void the warranty.    The instrument complies with part 15 of the FCC Rules. Operation is subject to the following two conditions: (1)  This  instrument  may  not  cause  harmful  interference,  and  (2)  this  instrument  must  accept  any  interference  received, including interference that may cause undesired operation.    Shielded cables must be used with the instrument to ensure compliance with the FCC Class A limits.    Technical Specification  Definition  Communications  USB    Connections  Three USB host ports and one USB device port  Two inputs (contact closure, TTL), two relay outputs, and one switched +12V DC 1A output  NOTICE: Switching voltages higher than 30V or greater than 1A of current may damage the  instrument.    Dimensions & Weight  W 54.4 X D 65.5 X H 53.1 cm (21.4 X 25.8 X 20.9 in), 24.9 kg (55 lbs.)   ...
  • Page 10: Setup/Operation

    Setup/Operation    The Assurance GDS PPMX and its components should be set up in the order described in this section. Gilson  TRILUTION® micro provides software control of the PPMX during setup and operation as described in this section.  For more information about TRILUTION micro, view the help information in the software, accessible from the    button.     Unpacking  The PPMX is delivered with most major components already assembled. Please keep the original packaging  (both internal boxes and the external crate) in case the PPMX needs to be returned to BioControl Systems for  repair.    It is recommended that two  people lift the PPMX out of the  box, as it weighs approximately 55  lbs. (24.9 kg).  Open the crate by unscrewing the 4 bolts at the bottom  of the crate (located just above the pallet).  Use a 9/16”  wrench if needed.  Lift straight up using handles on  both sides.  Remove the two grey foam pieces.  Remove the closed and open‐ended cardboard  accessories boxes by sliding them out from the bungee  cords.  Be careful not to drop the boxes while  disassembling the cords.    Remove the plastic bag covering the PPMX.   Grip the PPMX at the recesses near the base. There is  one recess in the front, one in the back, and one on  each side. Use these recesses when lifting the PPMX  out of the foam‐lined tray.    Do not attempt to lift the PPMX from the cover or  from the X‐arm (the horizontal arm). Always lift the instrument from its base.  Place the PPMX on a stable, level surface such as a lab bench, lab cart. Refer to Section 1: Safety.   Remove the blue film or lab tape protecting the rotating cover.  Remove the shipping brace from the rear of the instrument. Loosen  the thumb screws securing the shipping brace to the PPMX. After  removing the shipping brace, replace and tighten the thumb screws ...
  • Page 11: Removable Tray

      Remove the shipping bracket that attaches  the arm to the inside of the unit using the  allen wrench (5 mm) provided.     Note: Some older units have 2 clear tubing  pieces that are wrapped around the lead  screw instead, these should be removed and  saved.    10 Remove the white foam block preventing the  tray from moving.    11 Place all packaging materials inside the crate for long‐ term storage.  DO NOT TROW AWAY the interior  cardboard boxes as these are custom made for the  PPMX.    Keep the shipping brace, shipping  bracket, allen wrench and foam  block with the packaging.  Removable Tray  A removable tray for placement of labware and tip racks is  required. While holding the handles on the sides of the tray,  lower the tray onto the metal carrier. It is keyed and will only  mount one way. Observe that the tray is level and fully  seated on the metal carrier.      Rear Panel Connections  Refer to the diagrams on the next page when making the  connections described in this section.  The  input/output  contacts  on  the  rear  panel  are  used  for  communication between the alignment head and TRILUTION ...
  • Page 12   DC Power Output – The top terminal block has one +12V DC output, which is labeled.  The PPMX has one functional USB host port (the middle port) on the rear panel. The top port on the rear panel is  not supported. The USB ports can be used to connect USB drives (which can also be seen by the tablet when  plugged into the PPMX), keyboard, mouse, or any other compatible device (heater/chiller, barcode scanner, or  shaker, for example).    The USB device port is used for communication between the PPMX and the tablet or computer. A USB cable is  provided as a standard accessory. Refer to the diagram for the location of the USB device port.  The Ethernet Port, RS‐232 and HDMI are not supported.  Input/Output (Green)  USB host (Not Supported)  USB host  Ethernet (Not Supported)  USB device  RS‐232 (Not Supported)  HDMI (Not Supported)  Power receptacle  Power switch (MAINS)  Use the power cord on the external power supply to make the connection between the power receptacle on the  PPMX and the external power supply. The connection from the external power supply to the PPMX uses a  connector with a locking collar. Check the alignment of the pins and then push it in until it clicks and locks in  place. To disconnect, pull back on the locking collar and then disconnect the cable from the rear panel of the  PPMX. Locate the appropriate power cord for your line voltage and then make the connection between the  external power supply and the AC power source.  Install the Power/USB Cabling kit by following the supplied  instructions.  ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL...
  • Page 13: Front Panel Connections

    Front Panel Connections  The PPMX has two functional USB host ports on the front panel. The USB ports can be used to connect USB  drives (which can also be seen by the tablet/laptop when plugged into the PPMX), keyboard, mouse, or any  other compatible device (heater/chiller, barcode scanner or shaker, for example).    In a situation where an emergency stop is required, pressing the STOP button stops the PPMX immediately. The  protocol stops and results are displayed (after touching OK on the prompt).    USB host  STOP      UPS Battery Power and Line Conditioner   To prevent fluctuations in power to the PPMX and tablet/laptop, it is recommended that the following UPS  battery backup be used with the system:   Tripp Lite SU750XL or equivalent    Additionally, it is recommended that the PPMX be placed on a separate circuit from other equipment.    Power On and Start Up  To start the PPMX:    Make sure that the PPMX is connected to the external power supply and that the external power supply is  connected to a power source.  Turn power on at the external power supply (O is off, I is on).  Turn the PPMX power on using the MAINS power switch located on the rear panel. The indicator light on  the front panel will illuminate green.  Connect the control tablet/laptop to the PPMX and power it on.  Close the rotating cover door. The PPMX will not operate with the cover open.    Log In   When prompted, enter the “User name” and “Password”, and then select Accept  (or the X to cancel).  Password is case‐sensitive.  It is recommended to change the  password for the default Administrator (admin).      Select the “User name (Full name)” in software to go to the “User  properties” screen. ...
  • Page 14: User Management

    User Management  The user management feature in TRILUTION micro provides a way for  administrators to grant or restrict users access to programs and  features in the software.  User management is accessible from the main  screen shown when the software starts.      Select Manage Users in software to go to the “User  management” screen, which displays a list of users.  Select a user from the list.  Select Edit.  The “User properties” screen appears.    Edit any or all properties shown.  • “User name” may not be modified for the logged in  user.  For the default administrator (admin), only “Password”  • and “Feature permissions” may be modified.  Select Save, or Back to return to the previous screen without  saving.    To add a user (Administrators only), select Add and the “New user” screen appears.    Enter a User Name.  The user name cannot be the same as any other user name.  • The user name can be from 1 to 50 characters in length, must begin with an English letter or  • number and may contain the following special characters: _()‐@.and,.  Spaces are valid.    Enter the Full name for the user.   • The full name can be from 1 to 100 characters in length, must begin with an English letter or  number and may contain the following special characters: _()‐@.and,.  Spaces are valid.    Optionally, enter a “Password” for the user.  The user can change the password at any time.  It can be from 1 to 50 characters in length, must begin with an English letter or number and may  • contain the following special characters: _()‐@.and,.  Spaces are valid.  It is case‐sensitive, but it is not required (password can be blank).  •...
  • Page 15: Touchscreen Overview

    Touchscreen Overview  The following information provides an explanation of unique software interactions when running TRILUTION  micro on the touchscreen control tablet. It is recommended to keep the tablet plugged into a power source  whenever possible.  Communication errors can occur between the PPMX and control tablet if the battery runs  too low.    Refer to the table below for a description of the icons used in the on‐screen keyboard.    The following icons appear on several screens in TRILUTION micro.  To view the options to shut down the control tablet and/or TRILUTION micro, touch   on the main menu:    Touch Shutdown to close TRILUTION micro and shut down the control tablet.  • • Touch Restart TRILUTION micro to restart only the software, and not the control tablet.  Touch Cancel to go back to the main menu.  •   ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL...
  • Page 16: Alignment Protocol

    Alignment Protocol  Run the Alignment Protocol to ensure proper alignment of the PPMX. It is only necessary to run this protocol  when setting up the instrument for the first time after a move or if an alignment issue is suspected.    Pass the end of the alignment cable cord with pre‐wired  connector through the outlet at the back of the PPMX. Be sure  to go under the lead screw to allow for the full range of motion.    The connector is labeled BOTTOM because it connects to the  bottom set of green input/output ports on the rear panel of  the PPMX. Make the connection.                    The clips to secure the tip racks on the tray can  interfere with the alignment. Ensure  that the clips (  ) are positioned as shown in  the diagram below, and that the thumbscrews  have been tightened.    Close the rotating cover.    The tablet starts TRILUTION micro automatically  on power up.  If using a laptop, double click the  TRILUTION micro icon to start the software.     Select Run/manage protocols.  Ignore the “Create protocol” and  “Start utility” bars.    Select Run a protocol.     Select Alignment Protocol and then select Next.    ...
  • Page 17: Add Pipette And Pickpen Head(S)

    14 Select Continue.    15 Select Home   to go to the main menu    Add Pipette and PickPen Head(s)  Each head that may be used now, or in the future, must be added per the instructions that follow.    On the TRILUTION micro main menu, select Settings.   On the Settings menu, select Pipette heads.  Enter the serial number located on the pipette head and the pipette type (i.e. 8x200).    The PickPen head is added the same way using serial number HN12017.  All PickPen heads use this same  serial number in the software (they are physically serialized on the back for tracking purposes).  Choose  PickPen II as the type.   Select Save.  There will not be a message that the settings were saved.  Repeat steps 3 – 5 for additional heads. When finished adding heads, select Back.         Set Date & Time  Set the date and time to ensure a correct date/time stamp on protocol  runs. This should only have to be done once. On the Settings menu, select  Date/time, and then set the date, time, and time zone.    Install Chime Sound Box  To enable sound on the PPMX, a separate chime sound box can be added to the back of the  instrument per the instructions that follow:    Plug the green phoenix connector into the top green input/output port on PPMX rear  panel.   Position the sound box on the back center, above the shelf portion of  the PPMX and secure the plastic holder using the provided hardware  (the shorter screws are used on the top holes).  If there are already  screws in the locations specified, remove these first.  Adjust the volume using the volume dial.    There is also a reset button on the inside of the speaker. To use, push  and then reboot the PPMX system.                                                               Volume dial ...
  • Page 18: Run A Protocol

    Run a Protocol  The Labware setup guide screen displays the options for confirming the instrument setup.  Select Step‐by‐step wizard to do all of the following (in the order shown):  • Review a list of the materials.  • Review the layout of the tray and set up pipette head.  Set up the pipette, tip rack and additional labware.  • • Review protocol / deck.  For details, refer to Step‐by‐step Wizard on the next page.     Select Browse positions manually to do any of the following:  Review the layout of the tray and review pipette head.   • • Select and set up specific labware.  Review protocol / deck.  •   Select Skip setup to skip setup instructions and go to the Wizard complete screen. Protocol will be set to the  default values or the values used the last time the protocol was run.  This includes the number of samples and  tips in the reload block.    Step‐by‐step Wizard  Select   to go to the main menu.  Select Run a protocol.  Select your protocol, and then select Next.  The Scanning dialog appears while the software checks that the  PPMX is connected. If connected, the software goes to the next  screen. If not connected, a message will appear suggesting  possible solutions.  Enter sample number, kit and reagent information manually or  using a barcode reader and then select Next.  Select Step‐by‐step wizard.  Gather the materials in the Materials List and then select Next.  Wait for the software to finish “Preparing pipette head” and then  open the rotating cover.   ...
  • Page 19   Each tip rack consists of a tip pack and a tip reload block. To  assemble the tip rack:    Open the sealed blister pack.  Lift the tip pack out of the blister pack.  Set the tip pack on the tip reload block. Ensure that the  tip pack is fully seated on the tip reload block.   Mark the clear cover with an X and remove.  Save the clear plastic box and cover on hand for unused tips.    To install the tip rack:   Loosen the elbow thumbscrew for each clip.  Place the tip rack on the removable tray with the beveled  corner in the back left corner.  Rotate each clip so that it will effectively secure the tip rack  on the tray as shown in the image below.  Tighten the elbow thumbscrew for each clip.  Pipette tips are used from the bottom right and  moving up the column.    U se the Tip Mover to load the PickPen tips from the tip  racks (the tip mover can also be used to refill pipette tip  racks).  PickPen tips are used from the top left and  moving down the column.      NOTE: Always refill the pipette and PickPen tips off the  deck to prevent tips from falling into the open instrument  tracks.   Place Sample Block(s) with the BioControl label on the left side, strips are filled starting in the top left well  moving down a column.  Place the Resuspension Plate(s) with the A1 in the top left corner, columns are  filled starting in the top left well moving down a column.  RS Plate columns are filled in a skipped pattern  similar to the manual process.  The reservoir(s) should also be placed so that the A1 is in the top left  corner.   ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL...
  • Page 20 Place the Assurance GDS Reagent Holder on the deck so that the smaller  hole is on the top left side  a   Standard Concentration Reagent bottle (a)  b   High Throughput (HT) Reagent bottle (b)  If using the standard bottle, select False.  If using the HT bottle, select True.  There are indentations for the CR bottle lids on the holder.     Place the Gel Cooling Block so that the brand name is to the  front right side.  Place the HT Amplification Tube Block with the  slide bar on the left side.  Slice the amp tubes and expand the  plate prior to adding the lid.     15 If individual sample IDs need to be entered for each sample in  the sample block, this can be done manually or using a barcode  reader.    Select the sample that matches the location on the sample block, highlight the information in the field and  either manually type the sample ID or use the barcode reader to import the information for each well.   The sample selected will be highlighted on the sample block.  Samples are listed in rows starting with A1.       16 Review protocol / deck and then select Next.  17 Select Run protocol.  18 When prompted, Skip simulation request.                 ...
  • Page 21: Pause Or Stop A Running Protocol

    Pause or Stop a Running Protocol  While running a protocol from TRILUTION micro, click or touch anywhere on the PIPET STATUS image to  pause the run. The run will stop when it finishes its current action. The protocol run timer keeps  advancing during the pause. When prompted, select Continue to resume the run, or Stop to end the run  and view the results.    Do not pause the protocol while pipette tips are being picked up or ejected.    To stop the PPMX in an emergency, press the red STOP button on the front of the PPMX.  This action will  automatically end the current protocol run.  View Results  During and after a protocol run, information is available about reagent dispense volumes. After a protocol run,  results for that run are automatically displayed.  To view results:  Select   to go to the main menu.  Select Results.   Select a protocol, and then select Results.  Select a protocol run, and then select View.  Simulated runs are identified by    The first screen displayed when viewing results is  the Tray view screen. The colors indicate the  following information:  Red – Negative volume  Green – Volume in the tube or well  Blue – Empty tube or well  Pink – Tips  The top of the screen shows the status, the name of the protocol, the time it took to run or simulate the  protocol and generate the results, and the time of execution for the last step.  The Volume view screen displays information about the volume in the selected well or reservoir.  The top of the screen shows the status, the name of the protocol, the time it took to run or simulate the  protocol and generate the results, and the time of execution for the last step.  The text above the table lists the bed element name, the well location and label, and the current volume in  the well. The table lists the actions that occurred in the well or reservoir in the following order:  Initial volume (if any)  Volume added and the source of the volume added (bed element name and plate index or reservoir  number)  Volume removed  10 The Steps view screen displays the steps that were run in the protocol in the order of execution.  11 The top of the screen shows the status, the name of the protocol, the time it took to run or simulate the ...
  • Page 22: Run Report

    Run Report  The Run Report is a subset of the results and can be exported for viewing from the control tablet or laptop. It  cannot be viewed from within the software or on the tablet. It includes basic information about the protocol run,  the bed layout, and well tracking. It does not include the information about volume tracking.    Select   to go to the main menu.  Select Results.  Select a protocol, and then select Results.  Select a protocol run, and then select Export.  Select the file type for the exported file: .htm (default), .xml or .csv.  Browse for and select the USB drive, name the file (or accept the  default name, which is the name of the protocol), and then touch  Save. The Run Report is saved to the location.  Open the file on a laptop or desktop computer.  Log Out  Select   to go to the main menu.  Select Return to TRILUTION micro.  Select Log out to allow another user to log in to the software.    LIMS Compatibility  The PPMX is LIMS compatible when using a network enabled laptop.  To import data from a LIMS system, the following steps  should be followed:      Select Start utility.   Select LIMS Assistant.  Select IMPORT.  Browse to select the LIMS import file for the PPMX protocol  being run.  Select Import.  A notice will appear saying import was  successful.  Minimize LIMS Assistant program window.    Select Run/manage protocols.  Select Run a protocol.  Select your protocol, and then select Next.  The Scanning dialog appears while the software checks that the  PPMX is connected. If connected, the software goes to the next  screen. If not connected, a message will appear suggesting  possible solutions.  10 The sample number and reagent information will appear in the appropriate fields automatically, and select Next.  11 Select Step‐by‐step wizard and follow prompts. ...
  • Page 23: Import Protocol

    Import Protocol  To import a protocol:    Select   to go to the main menu.  Connect a USB drive containing the protocol file to one of the  USB ports on the front of the PPMX or the middle USB host port  on the rear panel (the top USB port on the rear panel is not  supported).  Select Manage protocols to go to the listing of protocols.  Select Import and then browse for your application protocol file  (.sqlite) on the USB drive.  Select the file and then select Open to import the protocol file.     Export Protocol  To export a protocol (and its results):    Select   to go to the main menu.  Select Manage protocols to go to the listing of protocols.  Select a protocol in the list. It will highlight when selected.  Select Export.  Browse for and select the destination (USB drive) for the protocol file, and then select Open. The protocol is  saved to the location with a .SQLITE extension.    Delete Protocol  To delete a protocol (and its results):   Select   to go to the main menu. Select Manage protocols to go to the listing of protocols. Select a protocol in the list. It will highlight when selected. Select Delete.    Change PPMX Serial Number in Software  To control a PPMX from TRILUTION micro, the serial number of PPMX must be entered into TRILUTION micro  software. When TRILUTION micro is factory‐installed on the supplied tablet/laptop, the serial number of the  corresponding PPMX is entered into the software. If installing a replacement computer, follow the instructions  below.    Go to the HOME screen. ...
  • Page 24: Troubleshooting

    Troubleshooting  TRILUTION micro will display a message if a known error is encountered. This section describes some of the more  common errors and how to prevent or resolve them.    Communication Loss  If a message appears that indicates that the PPMX cannot be found, check your settings (including serial number)  and cabling.    To re‐establish communication try the following:                     Turn off the PPMX.  Turn off the tablet (press the power button on the HOME screen,  then select Turn off tablet) or laptop.  Unplug the PPMX from the computer and disconnect the PPMX  power cord from the unit.  Plug the computer into the power source to ensure the battery is  charging.  Wait 5 – 10 min.  Reconnect the PPMX to the power supply and the computer to the PPMX.  Power the PPMX on first.  Power the computer on.  Proceed with selecting Run a protocol to check communication has been re‐established.    Re‐starting a Protocol after Communication Loss  If during a protocol there is a loss of communication between the computer and PPMX, the pipette head may be  frozen in position.  To manually reset the pipette head:    From the error message, choose “go to Manual control” or restart the  protocol Step‐by‐step wizard and follow prompts but instead of Run  protocol, select Manual control.  Check the box “Home in recovery mode” and select Home XYZ.  Pipette should return to the home position.    Hood Open  Close the rotating cover door. The PPMX will not operate with the cover or hood door open.    While the run is in progress, DO NOT open the  hood; however, if the hood has been opened,  you will see the following message. If you  choose to continue the run, close the rotating  cover door and then observe that the run ...
  • Page 25: Reporting An Error

    Reporting an Error  If an error window appears during a protocol, follow the instructions below:    Scroll to the bottom of the error box and take a photo or write down the additional Detail text information.  This information is important for Technical Services to be able to adequately diagnose the issue.      From the error message, select Manual control.  Check the box “Home in recovery mode” and select Home XYZ.  Pipette should return to the home position.    Technical Services  If you need assistance, please contact BioControl Systems Technical Services at 425.603.1123 or  techservices@biocontrolsys.com. To help us serve you quickly and efficiently, please refer to   Appendix B. Before Calling Us.  ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL...
  • Page 26: Maintenance

    To ensure proper performance of the PPMX the following routine cleaning procedures should be  performed on a regular basis.  It is recommended that these procedures be carried out at least weekly  following reagent dispense protocols or after each run following PickPen IMS protocols.  However,  based on the specific laboratory environment, more frequent cleaning may be necessary.      Always turn the power off to the PPMX before cleaning.     To clean the PPMX, lightly spray 70% isopropyl alcohol onto a paper towel and wipe the following non‐ disposable items:    Removable Tray  Pipette Head(s) [avoid introducing any liquid into the openings at the bottom]  Tip Reload Rack(s)  PickPen Magnetic Head [avoid introducing any liquid into the openings at the end of the carrier  sleeves…exposure of magnets or the inside of the carrier sleeves to moisture may result in corrosion,  preventing the device from operating properly]   GDS Reagent Holder  GDS Sample Bases    The Tip Disposal Bin(s), Gel Cooling Block(s), HT Amp Tube Block and Lid (if applicable) should be cleaned by lightly  spraying a paper towel with 10% bleach solution and wiping the outside surface.  Follow with 70% isopropyl  alcohol as described above to remove potentially corrosive residues.  All disposable reservoirs can be autoclaved.        To clean the computer, wipe the screen with a low lint cloth designed for electronics.  Do not use pre‐moistened alcohol or bleach wipes to clean the tablet/laptop screen.  Leave rotating cover down when instrument is not in use.  For a maintenance log, please refer to  Appendix C. Maintenance Log.    Pipette Head Calibration  To ensure proper performance of the pipette head cassette, it should be calibrated annually as a minimum.  Contact  BioControl Systems Technical Services at 425.603.1123 or techservices@biocontrolsys.com.  To help us serve you  quickly and efficiently, please refer to Appendix B. Before Calling Us.  It may be necessary to exchange pipette head cassettes while one is out for calibration.  When exchanging a pipette  head it is necessary to do two things:    Add the pipette head to the software by scanning or entering the calibration values.  For detailed  instructions, refer to Add Pipette Head(s).  Physically install the head on the instrument.  For detailed instructions and a diagram, refer to Step‐by‐ step wizard.  ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL...
  • Page 27: Alignment Calibration

      To verify the pipette head performance, please refer to Appendix E. Pipette Verification.    ISO 17025 calibrated pipette heads are also available from Gilson for an additional cost, please contact  BioControl Systems Technical Services for additional information.    Alignment Calibration  It may be necessary to run the Alignment Protocol to ensure proper  alignment of the PPMX if the unit is moved or an alignment issue is  suspected. For detailed instructions and a diagram, refer to Run Alignment  Protocol.    Preventative Maintenance  To ensure proper performance of the PPMX it is recommended that a preventative maintenance (PM) field visit  be scheduled annually.  This PM consists of the following:    Cleaning polyurethane running pads beneth fixed deck tray  Testing of removable tray for correct positioning  Cleaning/greasing the X rail  Cleaning/greasing the Y rails  Cleaning/greasing the Z lead screw  Cleaning/greasing the Z rails  Internal and external surface cleaning  Inspecting the X belt for excessive wear and proper tension  Inspecting tray elements for excessive wear  Re‐alignment of system    Contact BioControl Systems Technical Services at 425.603.1123 or techservices@biocontrolsys.com to  schedule.  To help us serve you quickly and efficiently, please refer to Appendix B. Before Calling Us.    Warranty  Units that are under warranty will be repaired and returned to the user at no charge.  Please refer to Appendix D.  Warranty Terms.  If you have any questions about applicability, contact your local BioControl Systems  representative.  For out‐of‐warranty repairs, contact your local BioControl Systems representative who will  discuss service options with you.    Instrument Return Procedure  Contact BioControl Systems Technical Services at 425.603.1123 or techservices@biocontrolsys.com to obtain  authorization before returning any BioControl Systems equipment.  To help us serve you quickly and efficiently,  please refer to Appendix B. Before Calling Us.  To return a piece of equipment: ...
  • Page 28: Parts List

    Appendix A  Parts List  Equipment  Description  BCS Part Number  79100  ASSURANCE GDS PPMX  WITH STANDARD COVER   79120  CONTROL TABLET WITH BCS TRILUTION MICRO SOFTWARE  79104  CONTROL TABLET HOLDER  79145  MICROSOFT SURFACE PRO 4 LAPTOP WITH BCS TRILUTION MICRO SOFTWARE  79146  MICROSOFT SURFACE KEYBOARD COVER  79158  MICROSOFT SURFACE PRO 4 PEN  79110  ALIGNMENT HEAD  79115  POWER SUPPLY 110V / 220V  79112  POWER CORD US  79113  POWER CORD EU  79116  USB CABLE  79147  PPMX PWR AND USB CABLING KIT  79121  BLACK PLUG FOR BACK COVER  79131  ALLEN WRENCH, 5 MM  79101  REMOVABLE TRAY 96 WELL  79105  PIPETTE TIP RELOAD RACK  79173  PICKPEN TIP RELOAD RACK  79109  TIP DISPOSAL BIN ...
  • Page 29 Disposables  Description  BCS Part Number  79102  DIAMOND BLISTER, DF200ST, FILTER, 960 TIPS  79107  4‐COLUMN REAGENT RESERVOIR, CASE OF 25  79119  1‐COLUMN REAGENT RESERVOIR, CASE OF 25  73087  ASSURANCE GDS PICKPEN II TIPS, RACKED  73085  ASSURANCE GDS PICKPEN II TIPS, BULK  73004  ADHESIVE FILM SHEETS, BOX OF 100  73026  ADHESIVE FILM STRIPS, BOX OF 200  73043  SAMPLE WELL BASE, BAG OF 10  73044  SAMPLE WELLS, BAG OF 200  73006  RESUSPENSION PLATES, CASE OF 120  ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL...
  • Page 30: Before You Call Us

    Appendix B  Before You Call Us  BioControl Systems Technical Services will be able to serve you more efficiently if you have the following  information on hand:  Serial number of the instrument(s) involved:  • The serial number for the PPMX is located on the inside panel of  the right support.   The serial number for the pipette head is located on the front  outside casing.  The serial number for the PickPen magnetic head is located on the  back outside casing.   The serial number for the control tablet is located on the outside  of the box.  The serial number for the Surface laptop is located behind the  support at the bottom.  List of concise symptoms being exhibited by the instrument.  • List of operating procedures / protocols and conditions you were using when the problem arose.  • Be prepared to email the exported protocol that was running when the issue occurred, refer to Export  • Protocol.  • List of all instruments in the configuration and the connections to those instruments.  • List of other electrical connections in the room.            ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL...
  • Page 31: Maintenance Log

    Appendix C  Maintenance Log  ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL...
  • Page 32: Warranty Terms

    Appendix D  Warranty Terms    BioControl Systems, Inc. (“BioControl” or “BCS”) warrants the Assurance GDS PickPen PIPETMAX   automation  equipment to be free from defects in materials and workmanship, when given normal, proper, and intended usage  for one (1) year from the date of delivery of this equipment to the original purchaser (“Buyer”).  BioControl agrees  during the applicable warranty period to repair or replace, at BioControl’s option, all defective equipment within 5  days after date of return to BioControl and without cost to Buyer.     This Limited Warranty shall apply to the following EQUIPMENT included in the Assurance GDS PIPETMAX System;  Assurance GDS PickPen PIPETMAX and control tablet.  BioControl shall not have any obligation under this Limited  Warranty to make repairs or replacements which are required by normal wear and tear, or which result, in whole  or in part, from catastrophe, fault or negligence of the Buyer, or anyone claiming through or on behalf of the  Buyer, or from improper use of the equipment, or use of the equipment in a manner for which it was not designed,  or by causes external to the equipment.    Buyer shall notify BioControl of any equipment believed to be defective during the warranty period.  At  BioControl’s option, such equipment shall be returned by Buyer, transportation and insurance prepaid, to  BioControl’s designated facility for examination and testing.  BioControl shall repair or replace, within 5 days of  receipt by BioControl, any such equipment found to be defective and promptly return such equipment to Buyer,  transportation and insurance prepaid. Should BioControl’s examination and testing not disclose any defect covered  by the foregoing warranty, BioControl shall so advise Buyer and return the equipment in accordance with buyer’s  instructions and at Buyer’s sole expense.  BioControl warrants its repair work and any replacement parts or  equipment for a period of 30 days from receipt by the Buyer of the repaired or replaced equipment or for the  remaining balance of the original warranty period set forth in the preceding paragraph, whichever is greater.    THE PROVISIONS OF THE FOREGOING LIMITED WARRANTY ARE IN LIEU OF ANY OTHER WARRANTY, WHETHER  EXPRESS OR IMPLIED, WRITTEN OR ORAL INCLUDING ANY WARRANTY OF MERCHANTABILITY OR FITNESS FOR A  PARTICULAR PURPOSE. BIOCONTROL’S LIABILITY ARISING OUT OF THE MANUFACTURE, SALE OR SUPPLYING OF  THE EQUIPMENT OR ITS USE OR DISPOSITION, WHETHER BASED UPON WARRANTY, CONTRACT, TORT OR  OTHERWISE, SHALL NOT EXCEED THE ACTUAL PURCHASE PRICE PAID BY BUYER FOR THE EQUIPMENT.  IN NO  EVENT SHALL BIOCONTROL BE LIABLE TO BUYER OR ANY OTHER PERSON OR ENTITY FOR SPECIAL, INCIDENTAL OR  CONSEQUENTIAL DAMAGES (INCLUDING, BUT NOT LIMITED TO, LOSS OF PROFITS OR LOSS OF USE DAMAGES)  ARISING OUT OF THE MANUFACTURE, SALE OR SUPPLYING OF THE EQUIPMENT.  THE FOREGOING WARRANTIES  EXTEND TO BUYER ONLY AND SHALL NOT BE APPLICABLE TO ANY OTHER PERSON OR ENTITY INCLUDING,  WITHOUT LIMITATION, CUSTOMERS OF BUYER.         ...
  • Page 33: Pipette Verification

    Appendix E  Pipette Verification  When neccesary, the following procedure can be used to verify PPMX pipette head performance:    Select “Run a protocol”  Select R – Standard Low Micro Calibration Verification protocol  Enter 8 samples  Weigh 2 empty GDS Sample Bases with one sample well strip each and 1 GDS Resuspension Plate prior to  start and record weight  Load removable tray with disposables according to PPMX Step‐by‐step wizard  Enter correct number of missing tips if not using a full rack  Vortex Concentration Reagent and remove cap prior to adding bottle to the GDS Reagent Holder  Add correct volume of Wash Solution and Resuspension Buffer to reagent reservoir   Select “Run protocol”  Select “Skip” when asked to simulate  Select “Continue” to prompt  When run is completed, weigh both filled GDS Sample Bases and the filled GDS Resuspension Plate and  record weight  NOTE: The protocol will fill the CR and Resuspension Buffer 5x the standard amount, the wash 1x (this is  the reason for the different calculations below).  Complete the following calculation for the Concentration Reagent & Resuspension Buffer:  (FP – DP) / 40 wells = ______________ x 1000 = __________ µL  Complete the following calculation for the Wash Solution:  (FP – DP) / 8 wells = ______________ x 1000 = __________ µL    Dry Plate (DP) Weight of Sample Blocks/Resuspension Plate    Concentration Reagent                 g  Wash Solution                 g  RS Plate Resuspension Buffer                 g    Filled Plate (FP) Weight of Sample Blocks/Resuspension Plate    Concentration Reagent                 g  Wash Solution                 g  RS Plate Resuspension Buffer                 g    Pipette should deliver 20 ± 1 µL for Concentration Reagent, 1000 ± 20 µL for Wash Solution, and 45 ± 2 µL for  Resuspension Buffer.      Concentration Reagent   __________ µL               ...
  • Page 34: Deck Layout For R-Standard Low Micro Calibration

    Deck Layout for R‐Standard Low Micro Calibration Verification  1 Trash bin  1  2  2 Pipette tips (200 µL filter)  3 Reagent reservoir (a Wash, b&c Empty, d RS Buffer)  4 Sample block 1 (1‐48 CR)  6  5 Empty  5  4  6 Sample block 3 (1‐48 Wash)  7 Reagent holder (a Std or b HT CR bottle)  8 RS plate 1 (1‐48 RS Buffer, skipped col.)  a  b  9 Empty  8  7    *Remove the PickPen Magnetic Head from the arm  prior to running this protocol  ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL...
  • Page 35 Appendix F  Best Practices   If using the R‐protocol + IMS‐protocol format, one removable tray should be for reagent dispensing (Work  Zone 1) and the other removable tray for sample preparation (Work Zone 2).     The Assurance GDS PickPen Magnetic Head should be removed when running the R‐protocols.     Load the 0.2 mL amplification tubes with the hinge to the right (so they open from the left), always load  them all the same direction.  Always skip columns (should match the resuspension plate).     For the 1‐Column Reservoir:   During the R‐Wash Solution/R‐Wash Solution Dual Dispense protocols, PPMX switches to the  second reservoir for samples 32 to 48 on sample block 5     For the 4‐Column Reservoir, most protocols use the columns as follows:   Columns 1 & 2 are for Wash Solution (PPMX uses the first column for up to 48 samples, from  sample 49 to 72, the second column is used)  Column 3 is for sterile media (BHI or DFB)  Column 4 is for Resuspension Buffer Tq     Re‐cap Concentration Reagent bottles after each run to prevent evaporative loss and store under  refrigeration     Cover reservoirs with leftover Wash Solution, Resuspension Buffer and/or sterile media with an adhesive  film sheet and store under refrigeration.  Notate the date and lot numbers if applicable.  Reservoirs with left  over Wash and RS Buffer are good for 24 hours.  Reservoirs are autoclavable.        Always keep the reservoirs filled to the appropriate level for reagents that are aspirated from the top (i.e.  Wash Solution and sterile media).     Container Type  Min  Fill  Max ...
  • Page 36 Appendix G  Pack Up     Unplug the Assurance GDS PPMX, place the black power supply in the mini white cardboard box and put  into the accessories box.  Unplug the control tablet or laptop, place the black USB cable/ferrite cores in their plastic bag and put  into the open‐ended accessories box.  Place control tablet/laptop and charger back into  the labeled computer box and put into the open‐ ended accessories box.  Place the control tablet holder (if applicable) in its  labeled box and put into the accessories box.  Place  all  the  deck  accessories  into  their  respective  plastic  bags  and  place  into  the  accessories box.  Trash  bin,  tip  reload  racks,  tip  puck,  reagent  holder  and  power  cords  (US  &  EU) in large plastic bag ...
  • Page 37 Install the Alignment Head on the left side of the PPMX arm by  securing it to the upper Pipette Head assembly with the thumb  nuts.    Remove the PickPen Magnetic Head. Wrap the PickPen Head in  bubble wrap and place in the accessories box large plastic bag  with other deck accessories.    Remove  the  deck  tray  and  set  aside,  slide  the  attached  metal  bottom sheet back so that the rectangular hole aligns with the  opening  in  the  base  and  press  the  white  foam  block  into  the  opening to prevent the sheet from moving during shipping.    Alignment Head  Tape the Alignment Head cable to the foam block.      Install the shipping bracket to the arm and inside back of the PPMX by using the allen wrench (5 mm)  provided to tighten both screws into place.   ...
  • Page 38 Hook the bungee cords together and place under the white foam insert which holds the PPMX unit.    Carefully  lower  the  PPMX  into  the  foam  insert  in  the  base  of  the  shipping  crate,  the  handholds  on  opposite ends of the instrument match with the clearance notches in the foam.    NOTE: Leave the rotating clear cover down when lifting PPMX to prevent damage from the lid crashing  forward.    Rotate  the  clear  cover  open  until  it  catches  on  the  magnets, using lab tape, secure tbe lower cover to the  upper cover.    Place the plastic bag over the unit.    Attach the bungee cords vertically around the PPMX ...
  • Page 39 Place the two grey foam inserts vertically on the sides of the PPMX for additional protection.    Gently lower the crate lid over the PPMX unit being careful not to loosen the grey foam pieces. This step  requires 2 people.    Attach the 4 bolts to the bottom of the crate using a 9/16” wrench.      For Reference:  Crate Shipping Size = 36”W x 32” L x 33”H  Crate Shipping Weight = 166 lbs                ASSURANCE GDS® PPMX USER MANUAL...
  • Page 40 Appendix H  Ordering Information  ATM kit components:   0.2 mL Amplification Tubes    7 mL Concentration Reagent (2 bottles)   Part No.  Description   71007‐576ATM  GDS for E. coli O157:H7 Tq  71008‐576ATM  GDS for Salmonella Tq  71022‐576ATM  GDS for Salmonella HET Tq  71009‐576ATM  GDS for Listeria spp. Tq   The following kits are sold separately but are required for the ATM kit:   Wash Solution   Part No.  Description  61031‐100  GDS Wash Kit (4 x 250 mL)    RS Buffer    Part No.  Description  34724‐100C  Assurance GDS Resuspension Buffer Tq (70 mL) 34745‐100C  Assurance GDS Listeria Resuspension Buffer Tq (70 mL)     If running a single wash protocol the ratio is 2 ATM kits to 1 Wash and RSB kit [2:1]   ...

Table of Contents