Download
Share
Print this page
Zeiss LSM 510 Inverted User Manual
  1. Manuals
  2. Brands
  3. Zeiss Manuals
  4. Microphone
  5. LSM 510 Inverted
  6. User manual
Zeiss LSM 510 Inverted User Manual

Zeiss LSM 510 Inverted User Manual

Hide thumbs Also See for LSM 510 Inverted:
1
2
3
4
5
6
7

Advertisement

Quick Links

Download this manual See also: Operating Manual, Quick Manual
 
Firstly please be aware that this microscope should be treated with respect and care at all times.  
Rules of use: 
This Microscope can only be used by Masters by Research or PhD students, Postdocs and members of staff.  
You must receive training from Ann Wheeler before you use this microscope.. 
The microscope lenses must be cleaned after every usage and the equipment treated carefully at all times.  
If you have any problems at all with the microscope, no matter how trivial they may seem please see Ann 
Wheeler, Amanda Wilson immediately.  
 
REMEMBER: You have 5GB of disk space on this microscope. Check before you start if you have room for your 
experiment. If not delete your old data. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
To switch on the microscope. 
Switch on the Mercury arc bulb 
Switch on the remote control button 
Switch on the computer 
Clean the objective lens you want to use before you start work 
Login to the computer 
1. Start the software 
Click the  ZEN shortcut button 
 
Use of the Zeiss LSM 510 Inverted 
Click start 
system
1

Advertisement

loading

Related Manuals for Zeiss LSM 510 Inverted

Summary of Contents for Zeiss LSM 510 Inverted

  • Page 1   Use of the Zeiss LSM 510 Inverted  Firstly please be aware that this microscope should be treated with respect and care at all times.   Rules of use:   This Microscope can only be used by Masters by Research or PhD students, Postdocs and members of staff.    You must receive training from Ann Wheeler before you use this microscope..   The microscope lenses must be cleaned after every usage and the equipment treated carefully at all times.    If you have any problems at all with the microscope, no matter how trivial they may seem please see Ann  Wheeler, Amanda Wilson immediately.     REMEMBER: You have 5GB of disk space on this microscope. Check before you start if you have room for your  experiment. If not delete your old data.                    To switch on the microscope.  Switch on the Mercury arc bulb  Switch on the remote control button  Switch on the computer  Clean the objective lens you want to use before you start work  Login to the computer  1. Start the software  Click the  ZEN shortcut button  Click start  system  ...
  • Page 2   The screen looks like this once you have switched everything on. The control menu is on the left and you work from top  to bottom. Your images are stored on the right.                                                           Light path (eyes  and laser is  controlled here)              2. Turn on the Lasers   To turn on lasers select LASER menu, RHS of workspace.  Drop it down using the small arrow in the left corner.       Select the lasers you need for your experiment and    turn them on      For the Argon and Enterprise lasers drop down the     Laser Properties arrow    For the Argon laser: switch it onto standby,  wait until it has  warmed up and then switch on, and set output to 6.1A.     NB is this uses more than 50% of the laser output see  Ann/Amanda    For the Enterprise laser: switch it onto standby, wait until it has  warmed up then switch on, and set the output to 100%             ...
  • Page 3   3. Select the Configuration you need    Pick Imaging Configuration from the drop down menu     Select the configuration you need       Click the icon to activate your chosen configuration              4. Set the Microscope up and find your specimen      Click the Ocular button to send the light to your eyes (top right area of the  workspace)     This will allow you to check your samples down the microscope before you start  laser scanning          In the Light Path control menu:    This opens the transmitted (Brightfield) light        Select the objective lens that you want to use    Select the appropriate filter (DAPI/FITC/TRITC)        Click the fluorescence shutter Open  to see fluorescent light ...
  • Page 4   5. Start confocal scanning                       Click LSM button (top right of the workspace)            Click the Fast button (found on top left of the workspace)    Click Split  on the left hand side of  your         image (this splits the image    according to channels used)                                                                                           6 . Set the levels for each channel          Click the coloured region under each channel (in the panel underneath the  image window) to activate the ‘range indicator’ palette;    the images will now go grey or Red and Blue                 Make sure the channels menu is in your workspace, if not click the right hand side arrow to 'float' the menu out   ...
  • Page 5   7 .Resize your images using the crop tool.        To stop scanning at any time click  Stop               Stop scanning and press Crop (bottom of screen)      Simply put the cropping window (Red box with cross hair) over the region you want to    crop Change the position, size or rotation of the cropped area by dragging the edges of the    crop box with the cursor   Start scanning again and your cropped image will appear     8. Set up the scanning parameters and selecting the area you want to image  Once you are happy with your image stop scanning    Go to the Acquisition Mode tab on the LHS of the  workspace and float out if not in workspace already.    Generally for a nice detailed picture:    Frame size should be 1024x1024  Scan speed: 7  Data depth should be 16 bit    Scan average should be 4    Optional if you don't want to use crop  To alter the scan area drop down the arrow  While the image is scanning: ...
  • Page 6   9. Take the picture            Click Single in the scan menu        10. Saving your Image(s)    Go to the Open Images section on the top right of the   workspace    Select the one that you want to save    Click the floppy disk icon to save the image   (please save to your folder in Users on E‐drive!!)  To convert to tif go to the file menu (top right)   and click Export.                To export just the raw data that you have pick the format (.tif) click export Raw  data Single plane (normal scan) or Series (Z stack or timelapse)  To export the image display including any overlays or analysis that has choose  export Contents of Image window or Full resolution image window Single plane  (normal scan) or Series (Z stack or timelapse).  Choose 'select file name and save' to save...
  • Page 7   12. To take a Z stack    Go to the Z‐Stack toolbar (found on the left side of the workspace) and drop it down  Click on the tick to activate the Z stack menu (you can't  collect a z stack without this) Its white when activated     Choose if you want to select first and last planes or to  collect data from a central point (BALM staff  recommend select first and last in general)    For stacks collected in select First and Last mode  Enter your required interval for z stack   Select Keep interval     Note: use Optimal Interval if you want the best  resolved stack (for 3D image generation)     Click Fast to start scanning   Move to the bottom your sample and hit set last   Move to the top of your sample and click set first     Click START to collect the Z stack                                                                                                      You can view the z series (and time series) as it is                 being collected using the Gallery option          13. Collecting a time series / timelapse ...