Zeiss AxioObserver D1 User Manual
  1. Manuals
  2. Brands
  3. Zeiss Manuals
  4. Microscope
  5. AxioObserver D1
  6. User manual

Zeiss AxioObserver D1 User Manual

Hide thumbs

Advertisement

Table of Contents

Advertisement

Table of Contents
loading

Related Manuals for Zeiss AxioObserver D1

Summary of Contents for Zeiss AxioObserver D1

  • Page 2: Start-Up Procedure

    Zeiss AxioObserver.D1 Microscope  Room: 3164A                            Start Up Procedure     1. Remove dust cover from microscope  2. Toggle FluoArc Lamp switch ON  3. Toggle Power Bar switch ON  4. Turn Microscope ON  ‐ by pressing power button located on left side of microscope  5. Turn ON computer  6. Log on to: Observer User account (no password)  7. Open Program: AxioVision Rel. 4.8    Shut Down Procedure    1. If used oil, gently remove oil from objective using neatly folded  dry lens paper ...
  • Page 3 Microscope Quick Guide   Zeiss AxioObserver.D1 Microscope Guide  Room: 3164A  Start Up Procedure  1. Remove dust cover from microscope  2 Toggle FluoArc Lamp switch ON  3 Toggle Power Bar switch ON  4 Turn Microscope ON  ‐ by pressing power button located on left side of microscope  5 Turn ON computer  6 Log on to: Observer User account (no password)  7 Open Program: AxioVision Rel. 4.8    Configuring Imaging Setup  1. If not already visible, open the Workarea window  2. From the Workarea menu, double‐click on Multidimensional Acquisition to expand list, and then  select Multidimensional Acquisition.  3. Under the   tab, click Load button. Select the appropriate experiment set‐up depending on  what channels you want to image (ie All Channels).  4. Select the colors tab  5. You can activate/deactivate channels by right‐mouse clicking on the channel number    Set Sample on Stage and Focus ...
  • Page 4 4. Repeat exposure time measurement for each channel, however, adjust the fine focus for only one  channel ie the most important one  5. To capture your final image, press the   button located at the bottom of the C tab.    Post‐Acquisition Adjustments    Brightness/Contrast  1. Temporarily turn off the pseudo‐coloring of the displayed image by pressing the   button. Each  channel is displayed in black/white; you can view one channel at a time.  2. Click on the properties button found below the image    3. While under Display tab of properties window, click the Min/Max button, or under your image, press  the   button.  4. You can make further adjustments using the displayed histogram (ie move top of line left, and bottom  of line right)  ‐ NOTE: do not adjust the Gamma  5. Repeat for each channel  6. Press the   button     Adding a Scale bar  1. To add a scale bar, press the                button, or Annotations from the main menu and select Scale bar.  2. Drag cursor along image to get desired scale bar size    Saving Files  1. From the main menu, select File  Save as  2.
  • Page 5 Microscope Controls    Objective NA Display Screen  Objective Contrast Method  Objective Type      HAL Lamp Voltage  Objective Magnification        TL Shutter (open)    RL Shutter (closed)   Condenser Contrast Method    Reflector     Transmitted Light Controls    Diaphragm Control Turns HAL Lamp on/off      Located on bottom right  Condenser contrast    of microscope  method      Located on bottom front of    microscope      Condenser aperture control Controls HAL lamp ...
  • Page 6 Objectives                                                             Zeiss AxioObserver.D1 Microscope Objectives  Room: 3164A     1  2  3  Plan‐Apochromat  A‐Plan 10x  LD Plan‐NeoFluar 20x  20x     0.25 Ph1  0.4 Korr Ph2 ‐ M27  0.8 M27  Magnification  10x  20x  20x  Numerical Aperture  0.25  0.4  0.8  Working Distance (mm)  4.2  7.9 at coverglass 0.75  0.55  Coverglass (mm)  0.17  0‐1.5  0.17  Immersion  None  None  None  Long Distance (LD)  ‐ ...
  • Page 7   Plan‐NeoFluar 100x  1.3 Oil Ph3  100x  1.3  0.2  0.17  Oil  ICS  ****  ****  ****  ***  ‐  ‐  Ph3  000000‐1031‐171                                       ...

  • Page 8: Filter Sets

    Filter Sets                                                                                                                                                                         Zeiss Axio Observer D1 Microscope Filters  Room 3164A    1. Transmitted Light    2. Filter Set 34 (DAPI/BFP)  Excitation:  BP  390/22  Beam Splitter:  FT  420  Emission:  BP  460/50    3. Filter Set 38 (Cy2/GFP)  Excitation:  BP  470/40  Beam Splitter:  FT  495  Emission:  BP  525/50    4. Filter Set 46 HE (YFP)   Excitation:  BP  500/25 ...

  • Page 9: Filter Set

    Filter set                                                                                                                                                                                                                                                        ...
  • Page 10                                                                                         ...
  • Page 11                                                           https://www.micro‐shop.zeiss.com/?p=us&f=f                 ...
  • Page 12 Attention Users!!    FluoArc Lamp:    The FluoArc lamp must be on for at least 30 minutes before being turned  off AND must not be turned on again within 1 hour of being turned off.   1. When starting, before you turn on the FluoArc lamp, make sure it  has been OFF for at least 1 hour from previous use.  When finishing, before you turn off the FluoArc lamp, make sure it    has been ON for at least 30 minutes.   Oil on Objectives:    If you used an oil objective, please remember to wipe oil off with dry Lens  Paper. Do not use ethanol!    Booking Time:    You are allowed to sign up for a maximum of 3 hours per day. Please  make sure you only book time that you need. You are responsible for  showing up for your time booked. A $10.00 fee applies if you did not  show up for booked time.    Log Book:    All users must log the time spent on the station as well as the time the  fluorescence lamp was turned on/off in the log book.     Save   Data:  Your   Save all of your work in D:/ drive, your lab‐folder, your folder. Files  found on the Desktop or in the C:/ drive will be deleted daily.    You are responsible for backing‐up your own data at all times. Do not  rely on this computer as storage for your data. Once you have backed‐up  your files elsewhere, please delete your files from this computer. ...
  • Page 13   Computer:    This computer is to be used only for image acquisition. No other work is  permitted!!    Immersion Oil Rules:     Always keep immersion oil bottle closed. This prevents water  evaporation and maintains the integrity of the oil   Keep oil bottle clean. Oil should never be found along the sides of  the bottle or around the neck   Apply only a small amount of oil to your coverslip    Oil droplet   Coverslip    Always load your sample on the microscope stage with the  objective lowered to the lowest focus position   Oil should never reach the outer rim of the objectives. The felt  protectors should never become saturated with oil           Always remove oil using dry Lens Paper from the objective when  changing slides. Re‐apply a small amount of new oil to the new slide   If you are imaging a sample using an oil objective, do not toggle  between objectives. Image with that objective only!   When done, thoroughly wipe off oil objective using Lens Paper    Do not get oil on any air objectives!   ...

Table of Contents